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IBM世界第一超级计算机立功:筛选出77种抗新冠病毒化合物

  • 2020-03-23 23:45
  • 来源:未知
  • 作者:admin
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在逝世活时速的抗疫比赛中,速度越快越好。

在这场抗疫比赛的背后,超等计算机成为了加快器。

据VentureBeat报道,IBM参加了由美国当局主导成立的COVID-19高机能计算联盟,赞助研究人员安排猜测模型,分析新冠疫情的成长过程,加快推动病毒治疗过程。

面对病毒(包含COVID-19病毒)这类新生化合物,研究人员会在实验室中培养微生物并不雅察其对引入的新生化合物的反响,逐渐缩小潜在变量的范围。

不过,零丁的变量可能包含着数百万甚至数十亿个数据须要模仿,仅依附研究人员的不雅察,将是个巨大年夜的挑衅。

今朝,全球正处于抗击疫情的异常时代。数据显示,全球新冠病例确诊已超33万人(截至发稿),且海外多个国度正处疫情暴发期,确诊数量还在赓续攀升。

在这场抗疫比赛中,时光是获胜的重要身分。对病毒的懂得多一点,对疫苗的研究更近一步,新冠病毒的威逼就少一分。

IBM研究总监DarioGil在博客中表示,在风行病学、生物信息学和分子建模的实验中须要大年夜量计算,假如手动进行,实验须要数年才能完成。

在参加COVID-19高机能计算联盟之前,Summit在新冠疫情研究中就已取得了冲破。美国橡树岭国度实验室(Oak Ridge National Laboratory)研究人员表示其团队借助Summit寻找到可以对抗COVID-19的最有效的现有药物。

经查询,其研究成果已揭橥至《ChemRxiv》杂志,论文题为“Repurposing Therapeutics for COVID-19: Supercomputer-Based Docking to the SARS-CoV-2 Viral Spike Protein and Viral Spike Protein-Human ACE2 Interface”。

据悉,IBM此次介入COVID-19研究的是Summit超等计算机,是今朝世界上最强大年夜的超等计算机。它由4608台计算办事器构成,每个办事器包含2个22核心IBM Power9处理器,6个NVIDIA Volta V100 GPU。别的,Summit还拥有跨越10PB的存储器,其计算才能最高可达200PFlops。

在此项研究中,研究人员从8000多种化合物入手,借助Summit的算法寻找可以与蛋白质结归并阻拦病毒发挥感化的药物。

假如在速度较慢的传统计算平台上操作也须要数月的时光,而超等计算机高机能的计算体系可以或许快速解决这一计算问题。

初步成果显示,今朝Summit已筛选出77种化合物可以或许与Spike蛋白结合,阻拦病毒外面的份子与人类细胞上的血管重要素转换酶2(angiotensin-convertingenzyme 2,ACE2)受体相连。

值得解释的是,尽管Summit计算可以或许在病毒研究方面发挥感化,但并不克不及够自行设计出一种治疗办法,其临床分析过程并不睬想,还需医疗机构对已筛选出的化合物进行评估、测试才能用于临床实验。

IBM超等计算机筛选出77种抗新冠病毒化合物:成抗疫生力军

别的,Summit帮助研究的办法仅是赞助缓解COVID-19的症状并进步存活率,而非疫苗研制。

不过,在COVID-19高机能计算联盟中,除了IBM,还包含了Google、微软、美国能源部、伦斯勒理工学院等其他公司以及学术机构;而这些机构的计算才能同样在病毒研究中发挥着感化。

亚马逊AWS部分启动一项筹划,为研究机构和公司供给技巧支撑,推动COVID-19在诊断、治疗、疫苗等方面的研究。同样,微软也表示将经由过程扩大对Azure和高机能计算才能的拜访,与科学家合作,为抗击COVID-19的研究人员供给所需对象。

伦斯勒理工学院将其人工智能多处理优化体系计算机(AiMOS)安排在伦斯勒计算立异中间,该学院表示正与研究机构接触,支撑与COVID-19有关的研究。

越来越多的力量参加了抗疫竞速之中,面对新冠病毒这一全人类的合营仇敌,多方合力,抗疫成效终会出现“1+1>2”。

IBM世界第一超等计算机建功:筛选出77种抗新冠病毒化合物

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